Diseño curricular del programa académico de la Maestría en Informática Médica Aplicada

Introducción: el Ministerio de Salud Pública de Cuba realiza numerosos esfuerzos por garantizar la informatización de sus procesos, donde la superación profesional representa un eslabón fundamental. La Escuela Nacional de Salud Pública implementa la Maestría en Informática en Salud, dirigida a los profesionales del sector que participan en el proceso de informatización. Sin embargo, el programa actual no se enfoca hacia el desarrollo de habilidades técnicas de los especialistas informáticos. Objetivo: diseñar el programa académico de la Maestría en Informática Médica Aplicada, enfocado al desarrollo de habilidades técnicas de los especialistas informáticos, que desde su puesto de trabajo contribuyen a la informatización de la salud pública cubana. Materiales y métodos: la investigación tiene un enfoque cualitativo, con alcance descriptivo, de tipo retrospectivo y diseño no experimental, de corte longitudinal. Se realizó un análisis documental, donde se identificaron las bases teóricas y los programas académicos existentes, que fundamentan el diseño curricular presentado. Resultados: se diseñó la propuesta de programa académico de la Maestría en Informática Médica Aplicada, con una estructura de 78 créditos. Cuenta con tres bloques de cursos básicos y especializados en temas de salud e informática. Es coordinado por la Universidad de las Ciencias Informáticas en colaboración con la Escuela Nacional de Salud Pública. Conclusiones: el programa implementado es pertinente y contribuye al desarrollo de habilidades técnicas en los especialistas informáticos, que participan en el proceso de informatización de la salud pública cubana, muestra de ello lo constituyen las estadísticas de la primera edición en curso de la maestría.

Introduction: The Cuban Ministry of Public Health makes numerous efforts to guarantee the computerization of its processes, where professional improvement represents a fundamental link. The National School of Public Health implements the Master´s Degree in Health Informatics aimed at managers of the sector who participate in the computerization process. However, the current program does not focus on developing the technical skills of computer specialists. Objective: To design the academic program of the Master´s Degree in Applied Medical Informatics, focused on the development of technical skills of computer specialists who, from their work position, contribute to the computerization of the Cuban public health. Material and methods: The research has a qualitative approach and a descriptive, retrospective, non-experimental, longitudinal design. A documentary analysis was carried out, where the theoretical bases and existing academic programs were identified, which underpin the presented curriculum design. Results: The proposed academic program for the Master´s Degree in Applied Medical Informatics was designed, with a structure of 78 credits. It has three blocks of basic and specialized courses in health and computer science topics. It is coordinated by the University of Informatics Sciences in collaboration with the National School of Public Health. Conclusions: The implemented program is relevant and contributes to the development of technical skills in computer specialists who participate in the process of computerization of Cuban public health, which is evidenced by the statistics of the first ongoing edition of the master´s program.

Diseño de sistema basado en reglas para apoyar la toma de decisiones de la población en la obtención de los medicamentos

En Cuba, el acceso a los servicios farmacéuticos por parte de la población se ve afectado por la no disponibilidad de medicamentos y la lejanía de las farmacias. La falta de información acerca de la existencia de los medicamentos y la cantidad de estos en la red de farmacias cercanas a una ubicación geográfica, aparejados al poco suministro de medicamentos y la calidad de la prestación del servicio, genera descontento e inconformidad en la población. En la presente investigación se realiza un diseño para mejorar la problemática planteada a partir de un sistema basado en reglas como ayuda a la toma de decisiones para la obtención de los medicamentos por parte de la población. Se aplica un estudio de caso mediante el cual es posible sugerir al usuario las 5 farmacias más cercanas donde el paciente puede adquirir los medicamentos sobre las decisiones asumidas.

In Cuba, access to pharmaceutical services by the population is affected by the non-availability of medicines and the remoteness of pharmacies. The lack of information about the existence of medicines and the quantity of these in the network of pharmacies close to a geographical location, coupled with the low supply of medicines and the quality of service provision, generates discontent and nonconformity in the population. In the present investigation, a design is carried out to improve the problem raised from a system based on rules as an aid to decision-making to obtain medicines by the population. A case study is applied through which it is possible to suggest to the user the 5 closest pharmacies where the patient can acquire the medicines on the decisions made.

Fusión de datos multimodales de neurociencias generados en estudios EEG-fMRI, un análisis temático / Fusion of Multimodal Neuroscience Data Generated in EEG-fMRI Studies, a Thematic Analysis

La actividad cerebral tiene múltiples atributos, entre ellos los eléctricos, metabólicos, hemodinámicos y hormonales. Los métodos modernos para estudiar las funciones cerebrales como el PET (Tomografía por Emisión de Positrones), fMRI (Imagen de Resonancia Magnética Funcional) y MEG (Magnetoencefalograma) son ampliamente utilizados por los científicos. Sin embargo, el EEG es una herramienta utilizada para la investigación y diagnóstico debido a su bajo costo, simplicidad de uso, movilidad y la posibilidad de monitoreo a largo tiempo de adquisición. Para detectar e interpretar las características relevantes de estas señales, se describe cada proceso por su escala temporal (EEG) y espacial (fMRI). La presente investigación se enfoca en realizar una revisión bibliográfica sobre la integración de datos multimodales EEG-fMRI que propicie valorar su importancia para el desarrollo de algoritmos de fusión y su uso en el contexto cubano. Para ello se analizaron documentos con altos índices de citas en la literatura, donde se destacan autores precursores de los temas en análisis. Los estudios multimodales EEG-fMRI generan múltiples datos temporales y espaciales con alto valor para la medicina basada en evidencia. La integración de los mismos provee un valor agregado en la búsqueda de nuevos métodos diagnósticos, aplicando minería de datos, Deep learning y algoritmos de fusión. En este trabajo se pone de relieve la existencia de baja resolución temporal de fMRI y por otro lado la baja resolución espacial de EEG, por lo que la integración de ambos estudios aumentaría la calidad de su información(AU)

Brain activity has multiple attributes, including electrical, metabolic, hemodynamic, and hormonal. Modern methods for studying brain functions such as PET (Positron Emission Tomography), fMRI (Functional Magnetic Resonance Imaging), and MEG (Magnetoencephalogram) are widely used by scientists. However, the EEG is a tool used for research and diagnosis due to its low cost, simplicity of use, mobility and the possibility of long-term monitoring of acquisition. To detect and interpret the relevant characteristics of these signals, each process is described by its temporal (EEG) and spatial (fMRI) scale. The present research focuses on conducting a bibliographic review on the integration of multimodal EEG-fMRI data that favors assessing its importance for the development of fusion algorithms and their use in the Cuban context. For this, documents with high rates of citations in the literature were analyzed, where precursor authors of the topics under analysis stand out. Multimodal EEG-fMRI studies generate multiple temporal and spatial data with high value for evidence-based medicine. Their integration provides added value in the search for new diagnostic methods, applying data mining, Deep learning and fusion algorithms. This work highlights the existence of low temporal resolution of fMRI and, on the other hand, the low spatial resolution of EEG, so the integration of both studies would increase the quality of their information(AU)

Una mirada actual a la caracterización de datos y ficheros de neurociencias / A Current Look at Characterization of Neuroscience Data and Files

Para los neurocientíficos constituye un desafío realizar un seguimiento de los datos y metadatos generados en cada investigación y extraer con precisión toda la información relevante, hecho crucial para interpretar resultados y requisito mínimo para que los investigadores construyan sus investigaciones sobre los hallazgos anteriores. Se debe mantener tanta información como sea posible desde el inicio, incluso si esta pudiera parece ser irrelevante, además de registrar y almacenar los datos con sus metadatos de forma clara y concisa. Un análisis preliminar sobre la literatura especializada arrojó ausencia de una investigación detallada sobre cómo incorporar la gestión de datos y metadatos en las investigaciones clínicas del cerebro, en términos de organizar datos y metadatos completamente en repositorios digitales, recopilar e ingresar estos teniendo en cuenta su completitud, y sacar provecho de dicha recopilación en el proceso de análisis de los datos. Esta investigación tiene como objetivo caracterizar conceptual y técnicamente los datos y metadatos de neurociencias para facilitar el desarrollo de soluciones informáticas para su gestión y procesamiento. Se consultaron diferentes fuentes bibliográficas, así como bases de datos y repositorios tales como: Pubmed, Scielo, Nature, Researchgate, entre otros. El análisis sobre la recopilación, organización, procesamiento y almacenamiento de los datos y metadatos de neurociencias para cada técnica de adquisición de datos (EEG, iEEG, MEG, PET), así como su vínculo a la estructura de datos de imágenes cerebrales (BIDS) permitió obtener una caracterización general de cómo gestionar y procesar la información contenida en los mismos(AU)

For neuroscientists, it is a challenge to keep track of the data and metadata generated in each investigation and accurately extract all the relevant information, a crucial fact to interpret results and a minimum requirement for researchers to build their investigations on previous findings. Keep as much information as possible from the start, even if it may seem irrelevant and record and store the data with its metadata clearly and concisely. A preliminary analysis of the specialized literature revealed an absence of detailed research on how to incorporate data and metadata management in clinical brain research, in terms of organizing data and metadata completely in digital repositories, collecting and inputting them taking into account their completeness. , and take advantage of such collection in the process of data analysis. This research aims to conceptually and technically characterize neuroscience data and metadata to facilitate the development of computer solutions for its management and processing. Different bibliographic sources were consulted, as well as databases and repositories such as: Pubmed, Scielo, Nature, Researchgate, among others. The analysis on the collection, organization, processing and storage of neuroscience data and metadata for each data acquisition technique (EEG, iEEG, MEG, PET), as well as its link to the brain imaging data structure (BIDS) allowed to obtain a general characterization of how to manage and process the information contained in them(AU)

Herramienta de gestión de colas y tareas de procesamiento de neurodatos para la plataforma BrainSSys / Neurodata Processing Task and Queue Management Tool for the BrainSSys Platform

Las neurociencias constituyen un campo de la ciencia que estudia el sistema nervioso desde el funcionamiento neuronal hasta el comportamiento y cómo sus diferentes elementos interactúan. El Centro de Neurociencias de Cuba es la principal institución de investigación de neurociencia en el país, donde fueron identificadas distintas problemáticas asociadas al lanzamiento y gestión de colas de procesamiento de datasets de neurociencias. El procesamiento que se desarrolla sobre sus bases de datos se realiza de forma manual en sus servidores de HPC (High Performance Computer) debido a dificultades tecnológicas y financieras para acceder a los servicios que ofrecen las plataformas internacionales, por lo que los investigadores se ven obligados a programar instrucciones en consola para ejecutar tareas de procesamiento y análisis. El objetivo de la presente investigación fue desarrollar una herramienta que automatice el proceso de gestión de colas y tareas de procesamiento de neurodatos para la plataforma BrainSSys. Se empleó Python como lenguaje de programación, PyQt5 como marco de trabajo y se utilizó el editor de código Sublime Text 3. Se obtuvo como resultado una herramienta que permite automatizar la gestión de las colas de procesamiento en la plataforma BrainSSys. Las pruebas realizadas determinaron la aceptación y la evaluación funcional de la herramienta, siendo en ambos casos de gran valor para la calidad de la propuesta solución(AU)

Neuroscience is a field of science that studies the nervous system from neural functioning to behavior and how its different elements interact. The Cuban Neuroscience Centre is the main neuroscience research institution in the country, where different problems associated with the launch and management of neuroscience dataset processing queues has been identified. The processing of its databases is carried out manually on their HPC (High Performance Computer) servers due to technological and financial difficulties in accessing the services offered by international platforms, so researchers are forced to program instructions on the console to execute processing and analysis tasks. The aim of this research was to develop a tool that automates the queue management process and neurodata processing tasks for the BrainSSys platform. Python was used as programming language, PyQt5 and Sublime Text 3 as framework and code editor respectively. The result is a tool that automates the management of processing queues on the BrainSSys platform. The tests carried out determined the acceptance and functional evaluation of the tool, being in both cases of great value for the quality of the proposed solution(AU)

Funcionalidades de estadísticas y reportes para el Repositorio cubano de datos de neurociencias / Statistics and Reporting Functionalities for the Cuban Neuroscience Data Repository

Para la organización de bases de datos de Neurociencias se han realizado diversos proyectos en países desarrollados, entre estos los repositorios de datos. El Centro de Neurociencias de Cuba es la institución rectora de los estudios neurocientíficos en el país. Debido a los volúmenes de datos que se manejan en su repositorio se dificulta el manejo estadístico y la obtención de reportes. El repositorio carece de herramientas para el análisis estadístico del universo de datos almacenado, dificultando la toma de decisiones sobre los diferentes tipos de datos. En base a las deficiencias identificadas se decidió desarrollar un grupo de funcionalidades de estadísticas y reportes que permiten la extracción de información útil desde diferentes perspectivas, beneficiando a los científicos de neurociencias en el estudio y aplicación de escenarios para el tratamiento de los datos almacenados. Se realizó un análisis del estado del arte de las herramientas que permiten generar reportes y estadísticas de los datos almacenados en un repositorio o en una base de datos. Para el desarrollo se utilizaron tecnologías y herramientas como Visual Paradigm para el modelado, PostgreSQL para el manejo de los datos, Django como framework de desarrollo y el lenguaje de desarrollo Python. El resultado obtenido propiciará una herramienta con características similares a sus homólogas internacionales(AU)

Various projects have been carried out in developed countries for the organization of Neuroscience databases, including data repositories. The Cuban Neuroscience Center is the leading institution for neuroscientific studies in the country. Due to the volumes of data that are managed in its repository, statistical management and obtaining reports are difficult. The repository lacks tools for statistical analysis of the universe of data stored, making it difficult to make decisions about the different types of data. Based on the deficiencies identified, it was decided to develop a group of statistical and reporting functionalities that allow the extraction of useful information from different perspectives, benefiting neuroscience scientists in the study and application of scenarios for the treatment of stored data. An analysis of the state of the art of the tools that allow generating reports and statistics of the data stored in a repository or in a database was carried out. For the development, technologies and tools such as Visual Paradigm for modeling, PostgreSQL for data management, Django as a development framework and the Python development language were used. The result obtained will provide a tool with similar characteristics to its international counterparts(AU)

Impacto de la Maestría en Informática Médica Aplicada en la informatización de la salud pública cubana / Master´s degree on Applied Medical Informatics - Its impact on Cuban Public Health informatics system / Impacto do Mestrado em Informática Médica Aplicada na informatização da saúde pública cubana

RESUMEN Introducción: El Ministerio de Salud Pública de Cuba realiza numerosos esfuerzos por garantizar la informatización de sus procesos, donde la superación profesional representa un eslabón fundamental. La Escuela Nacional de Salud Pública implementa la Maestría en Informática en Salud, dirigida a los directivos del sector que participan en el proceso de informatización. Sin embargo, el programa actual no se enfoca hacia el desarrollo de habilidades técnicas de los especialistas informáticos. Objetivo: Diseñar el programa académico de la Maestría en Informática Médica Aplicada y evaluar su impacto en el proceso de informatización de la salud pública cubana. Método: Estudio con enfoque mixto, alcance descriptivo, de tipo retrospectivo y diseño no experimental, de corte transversal. Se realizó un análisis documental para fundamentar el diseño del programa académico de la maestría y se aplicó un cuestionario para evaluar su impacto en el proceso de informatización de la salud pública cubana, con una muestra aleatoria (n=63). Resultados: Se diseñó el programa académico de la Maestría en Informática Médica Aplicada, con una estructura de 78 créditos. Fue coordinado por la Universidad de las Ciencias Informáticas en colaboración con la Escuela Nacional de Salud Pública. Además, se evaluó su impacto en el proceso de informatización de la salud pública cubana a partir de análisis estadísticos con los datos obtenidos. Conclusiones: El programa implementado es pertinente e impacta en el proceso de informatización de la salud pública cubana, muestra de ello lo constituye las estadísticas de la primera edición en curso de la maestría.

ABSTRACT Introduction: The Ministry of Public Health in Cuba is making numerous efforts to embed an informatics infrastructure in all its process where professionals with a high level of knowledge on the subject it´s essential. The National School of Public Health implements the Master's Degree in Health Informatics, aimed at the sector's managers who are involving in the informatics process. However, the current program does not focus on developing the technical skills of computer specialists. Objective: To design the academic program of the Master's Degree in Applied Medical Informatics and to evaluate its impact on the informatics process of Cuban public health. Method: A mixed approach, descriptive, retrospective and non-experimental design, and cross-sectional study, was carried out. A documentary analysis was conducted to support the design of the program and a questionnaire was applied to evaluate its impact on the informatics process of Cuban public health, with a sample randomly selected (n=63). Results: The academic program for the Master's Degree in Applied Medical Informatics was designed with a structure of 78 credits. Created in mutual collaboration between the Universidad de las Ciencias Informáticas (UCI) and the National School of Public Health. In addition, its impact on the informatics process of Cuban Public Health was evaluated on the basis of statistical analysis of data obtained. Conclusions: The program implemented is advisable and its successfully impact on the informatics process of Cuban public health, was reflected in the statistics of the first ongoing edition of the master's program.

RESUMO Introdução: O Ministério de Saúde Pública de Cuba realiza numerosos esforços para garantir a informatização de seus processos, onde o aperfeiçoamento profissional representa um elo fundamental. A Escola Nacional de Saúde Pública implementa o Mestrado em Informática em Saúde, destinado a gestores do setor que participam no processo de informatização. No entanto, o programa atual não se concentra no desenvolvimento de habilidades técnicas de especialistas em informática. Objetivo: Desenhar o programa acadêmico do Mestrado em Informática Médica Aplicada e avaliar seu impacto no processo de informatização da saúde pública cubana. Método: Estudo com abordagem mista, âmbito descritivo, tipo retrospectivo e desenho não experimental, transversal. Foi realizada uma análise documental para subsidiar o desenho do programa acadêmico do mestrado e aplicado um questionário para avaliar seu impacto no processo de informatização da saúde pública cubana, com amostra aleatória (n=63). Resultados: Foi elaborado o programa acadêmico do Mestrado em Informática Médica Aplicada, com uma estrutura de 78 créditos. Foi coordenado pela Universidade de Ciências Informáticas em colaboração com a Escola Nacional de Saúde Pública. Além disso, avaliou-se seu impacto no processo de informatização da saúde pública cubana com base em análises estatísticas com os dados obtidos. Conclusões: O programa implantado é relevante e impacta o processo de informatização da saúde pública cubana, exemplo disso são as estatísticas da primeira edição em andamento do mestrado.

Esquema de confianza basado en Infraestructura de clave pública (PKI) para el intercambio de información clínica electrónica en el sistema XAVIA HIS / PKI-based trust scheme for the exchange of electronic clinical information in the XAVIA HIS system

La seguridad informática se ha convertido en una necesidad y un derecho de todos los ciudadanos. Los sistemas informáticos empleados en el sector de salud poseen un almacenamiento digital fácil y sostenible que debe garantizar la privacidad e integridad de la información, lo cual constituye cuestión delicada. En Cuba no está definido un esquema PKI (Públic Key Infraestructure) o Infraestructura de Clave Pública, centralizado a nivel nacional que propicie y garantice la seguridad de la información sensible en el sistema de salud pública, lo cual pone en riesgo la autenticidad, integridad y confidencialidad de los datos médicos personales. Este trabajo tiene como objetivo diseñar una estructura de seguridad centrada en la PKI entre las instituciones de salud, a partir de la infraestructura de llave pública nacional como autoridad de certificación raíz. Se realizó un análisis documental sobre la actualidad del tema, se realizaron entrevistas a administrativos, gestores hospitalarios y especialistas en seguridad informática, lo cual permitió crear las bases de la investigación. Se obtuvo un esquema de confianza que propicia el intercambio seguro de los registros médicos de los pacientes entre instituciones de salud. La implementación de una infraestructura PKI en el sector sanitario permite que las instituciones que requieran intercambiar registros médicos, a través de una red, puedan hacerlo con un alto nivel de seguridad(AU)

Computer security has become a necessity and a right for all citizens. The IT systems used in the health sector have much easier and more sustainable digital storage and guarantee the privacy and integrity of information, which are sensitive issues. In Cuba, there is no centralized PKI (Public Key Infrastructure) scheme at the national level that promotes and guarantees the security of sensitive information in the public health system, which puts the authenticity, integrity and confidentiality of personal medical data at risk. The aim of our work was to design a security structure centered on PKI among health institutions, based on the national public key infrastructure as root certificate authority (CA). In order to achieve this, a documentary analysis was carried out on the current state of the art in the subject; as well as interviews with administrative staff, hospital managers and specialists in computer security, which allowed the research bases to be created. As a result, a trust scheme was obtained that promotes the secure exchange of patients' medical records between health institutions. The implementation of a PKI infrastructure in the health sector allows institutions to exchange medical records through a network with a high level of security(AU)

Proceso para la fusión de neuroimágenes de Tomografía por Emisión de Positrones y Resonancia Magnética / Process for the fusion of Positron Emission Tomography and Magnetic Resonance neuroimaging

En radiología se utilizan varias técnicas imagenológicas para el diagnóstico de enfermedades y la asistencia en intervenciones quirúrgicas con el objetivo de determinar la ubicación y dimensión exacta de un tumor cerebral. Técnicas como la Tomografía por Emisión de Positrones y la Resonancia Magnética permiten determinar la naturaleza maligna o benigna de un tumor cerebral y estudiar las estructuras del cerebro con neuroimágenes de alta resolución. Investigadores a nivel internacional han utilizado diferentes técnicas para la fusión de la Tomografía por Emisión de Positrones y Resonancia Magnética al permitir la observación de las características fisiológicas en correlación con las estructuras anatómicas. La presente investigación tiene como objetivo elaborar un proceso para la fusión de neuroimágenes de Tomografía por Emisión de Positrones y Resonancia Magnética. Para ello se definieron 5 actividades en el proceso y los algoritmos a utilizar en cada una, lo cual propició identificar los más eficientes para aumentar la calidad en el proceso de fusión. Como resultado se obtuvo un proceso de fusión de neuroimágenes basado en un esquema híbrido Wavelet y Curvelet que garantiza obtener imágenes fusionadas de alta calidad(AU)

In radiology, various imaging techniques are used for the diagnosis of diseases and assistance in surgical interventions with the aim of determining the exact location and dimension of a brain tumor. Techniques such as Positron Emission Tomography and Magnetic Resonance can determine the malignant or benign nature of a brain tumor and study brain structures with high-resolution neuroimaging. International researchers have used different techniques for the fusion of Positron Emission Tomography and Magnetic Resonance, allowing the observation of physiological characteristics in correlation with anatomical structures. The present research aims to develop a process for the fusion of neuroimaging of Positron Emission Tomography and Magnetic Resonance Imaging. Five activities were defined in the process and the algorithms to be used in each one, which led identifying the most efficient ones to increase the quality in the fusion process. As a result, a neuroimaging fusion process was obtained based on a hybrid Wavelet and Curvelet scheme that guarantees high quality merged images(AU)

Técnicas de segmentación y procesamiento para la detección de Carcinomas Renales en imágenes de Tomografía Abdominal / Segmentation and processing techniques for the detection of Renal Carcinomas in Abdominal Tomography images

Una de las campañas más reconocidas en el mundo es la lucha contra el cáncer, siendo el sistema renal uno de los más afectados por esta patología. El carcinoma de células renales (CCR), el más común de cáncer renal en los adultos, representa la sexta causa de muerte por cáncer. Debido al aumento en el uso de las técnicas de diagnóstico por imagen, las lesiones renales pueden ser diagnosticadas en forma incidental aproximadamente en 50% de los casos. Cuba apuesta por el uso de la tecnología en la salud y en la Universidad de las Ciencias Informáticas (UCI) se ha desarrollado un sistema para el almacenamiento, transmisión y visualización de imágenes médicas (XAVIA PACS), el cual se encuentra implantado en varios hospitales del país, pero no cuenta con alternativas para realizar la detección del CCR en imágenes tomográficas, haciendo más lento el diagnóstico, lo que se traduce en menos posibilidades para el paciente. La presente investigación tiene como objetivo realizar un análisis sobre las principales técnicas de segmentación y procesamiento para la detección de carcinomas renales en imágenes de tomografías abdominal, que propicie a los equipos de desarrollo contar con la base teórica necesaria para enfrentar el problema en cuestión. Para ello se realizó un análisis documental sobre trabajos relacionados con la temática y que propician soluciones al problema. Se estudiaron algoritmos y técnicas computacionales efectivas para la segmentación y procesamiento de imágenes abdominales. Como resultado de la investigación se obtuvieron los algoritmos más acordes para el sistema XAVIA PACS y el contexto médico cubano(AU)

One of the most recognized campaigns in the world is the fight against cancer, the kidney system being one of the most affected by this pathology. Renal cell carcinoma (RCC), the most common form of kidney cancer in adults, represents the sixth leading cause of cancer death. Due to the increased use of diagnostic imaging techniques, kidney injuries can be diagnosed incidentally in approximately 50% of cases. Cuba is committed to the use of technology in health and a system for the storage, transmission and display of medical images (XAVIA PACS) has been developed at the University of Computer Sciences (UCI), which is implanted in several hospitals of the country, but it does not have alternatives to detect RCC in tomographic images, slowing down the diagnosis, which translates into fewer possibilities for the patient. The objective of this research is to carry out an analysis on the main segmentation and processing techniques for the detection of renal carcinomas in abdominal tomography images, which provides development teams with the theoretical basis necessary to face the problem in question. For this, a documentary analysis was carried out on works related to the subject and that provide solutions to the problem. Algorithms and effective computational techniques for the segmentation and processing of abdominal images were studied. As a result of the research, the most suitable algorithms for the XAVIA PACS system and the Cuban medical context were obtained(AU)

Componente de software para el proceso de solicitudes de evaluación de estudios neurofisiológicos para el Sistema XAVIA HIS / Software component for the process of requests for evaluation of neurophysiological studies in the XAVIA HIS System

Introducción: la especialidad de neurofisiología se ocupa del estudio, la evaluación del sistema nervioso (central y periférico), su modificación funcional, de los órganos sensoriales y musculares, tanto en condiciones normales como patológicas. La normalización de la información sobre esta especialidad es compleja, porque cada institución hospitalaria cubana tiene sus propias fuentes de gestión. Esta situación dificulta la homogeneización de los datos, la recopilación de información estadística y su inclusión en el registro médico digital único del paciente cubano. Objetivo: presentar un componente de software que informatiza las solicitudes de estudios neurofisiológicos para las instituciones de salud cubanas, que utilizan el Sistema de Información Hospitalaria XAVIA HIS. Método: se entrevistaron a especialistas del Centro Cubano de Neurociencias CNEURO, para definir el proceso de gestión de las solicitudes de estudios neurofisiológicos. Se aplicó la entrevista semiestructurada, que permitió la adaptación a los entrevistados para aclarar términos, identificar ambigüedades y reducir los formalismos. Para el desarrollo se utilizaron herramientas de software libre (JBoss Developer Studio como entorno integrado de desarrollo, Java como lenguaje de programación orientado a objetos, JBoss como servidor de aplicaciones y PostgreSQL v9.4 como sistema de gestión de bases de datos), que garantizan las políticas de desarrollo de software y soberanía tecnológica de Cuba. Resultados: las solicitudes de estudios neurofisiológicos en el sistema XAVIA HIS, se informatizaron a partir de un componente de software, basado en el estándar HL7-CDA para documentos clínicos. Conclusiones: los especialistas en neurofisiología disponen de funcionalidades para la estandarización, almacenamiento y gestión de la información de la especialidad, lo cual conduce al enriquecimiento de la historia clínica digital del sistema XAVIA HIS(AU)

Introduction: The Neurophysiology specialty deals with the nervous system (central and peripheral) study and assessment and its functional modification and the sense and muscular organs, both in normal and pathological conditions. Information standardization on this specialty is complex because each Cuban hospital institution has its own management sources. This situation makes it difficult to homogenize the data, gather statistical information and include it in the Cuban patient unique digital medical record. Objective: Describe a software component that computerizes neurophysiological studies requests for Cuban health institutions that use the XAVIA HIS Hospital Information System. Method: Specialists from the Cuban Neuroscience Center CNEURO were interviewed to define the neurophysiological studies requests management process. The semi-structured interview was applied, which allowed the adaptation to the interviewees in order to clarify terms, identify ambiguities and reduce formalisms. Free software tools were used for development (JBoss Developer Studio as an integrated development environment, Java as an object-oriented programming language, JBoss as an application server and PostgreSQL v9.4 as a database management system) that guarantee the Cuban software development and technological sovereignty policies. Results: Neurophysiological studies requests in the XAVIA HIS system were computerized using a software component, based on the HL7-CDA standard for clinical documents. Conclusions: Neurophysiology specialists have functionalities for the specialty information standardization, storage, and management, which leads to the XAVIA HIS system digital medical record enrichment(AU)

Análisis y selección de técnicas para la fusión de imágenes PET/CT basado en software / Analysis and selection of techniques for the fusion of PET/CT imaging based on software

Técnicas como la Tomografía por Emisión de Positrones y la Tomografía Computarizada permiten determinar la naturaleza maligna o benigna de un tumor y estudiar las estructuras anatómicas del cuerpo con imágenes de alta resolución, respectivamente. Investigadores a nivel internacional han utilizado diferentes técnicas para la fusión de la Tomografía por Emisión de Positrones y la Tomografía Computarizada porque permite observar las funciones metabólicas en correlación con las estructuras anatómicas. La presente investigación se propone realizar un análisis y selección de algoritmos que propicien la fusión de neuroimágenes, basado en la precisión de los mismos. De esta forma contribuir al desarrollo de software para la fusión sin necesidad de adquirir los costosos equipos de adquisición de imágenes de alto rendimiento, los cuales son costosos. Para el estudio se aplicaron los métodos Análisis documental, Histórico lógico e Inductivo deductivo. Se analizaron e identificaron las mejores variantes de algoritmos y técnicas para la fusión según la literatura reportada. A partir del análisis de estas técnicas se identifica como mejor variante el esquema de fusión basado en Wavelet para la fusión de las imágenes. Para el corregistro se propone la interpolación Bicúbica. Como transformada discreta de Wavelet se evidencia el uso de la de Haar. Además, la investigación propició desarrollar el esquema de fusión basado en las técnicas anteriores. A partir del análisis realizado se constataron las aplicaciones y utilidad de las técnicas de fusión como sustitución a los altos costos de adquisición de escáneres multifunción PET/CT para Cuba(AU)

Techniques such as Positron Emission Tomography and Computed Tomography allow to determine the malignant or benign nature of a tumor and to study the anatomical structures of the body with high resolution images, respectively. International researchers have used different techniques for the fusion of Positron Emission Tomography and Computed Tomography because it allows observing metabolic functions in correlation with anatomical structures. The present investigation proposes to carry out an analysis and selection of algorithms that favor the fusion of neuroimaging, based on their precision. In this way, contribute to the development of fusion software without the need to purchase expensive high-performance imaging equipment, which is expensive. For the study the documentary analysis, logical historical and deductive inductive methods were applied. The best algorithm variants and techniques for fusion were analyzed and identified according to the reported literature. From the analysis of these techniques, the Wavelet-based fusion scheme for image fusion is identified as the best variant. Bicubic interpolation is proposed for co-registration. As a discrete Wavelet transform, the use of Haar's is evidenced. In addition, the research led to the development of the fusion scheme based on the previous techniques. From the analysis carried out, the applications and usefulness of fusion techniques were verified as a substitute for the high costs of acquiring PET / CT multifunction scanners for Cuba(AU)

Impacto de las aplicaciones y servicios informáticos desarrollados por la Universidad de las Ciencias Informáticas para el sector de la salud / Impact of Applications and Computer Services Developed by the University of Informatics Sciences for the Health Sector

La implementación de aplicaciones y servicios informáticos en el sector de la salud es uno de los desafíos de las tecnologías de la información y las comunicaciones. La informática médica como disciplina integradora recibe un importante impacto del enfoque de la ciencia, la tecnología y la sociedad que domina el campo biomédico, las ciencias biotecnológicas y farmacéuticas. La Universidad de Ciencias Informáticas (UCI) desde su fundación ha participado en el desarrollo de aplicaciones y servicios informáticos para el sector sanitario cubano. Esta universidad ha desarrollado e implementado la Plataforma de imágenes médicas, el Sistema de Información Hospitalaria y el Sistema de manejo de datos de Ensayos Clínicos. Estas aplicaciones introducen en la sociedad cubana un valor constituido en beneficios sociales, económicos y culturales-organizacionales. Además, contribuyen a la gestión de las instituciones de salud y la eficiencia económica. Este artículo describe el impacto social, económico y ambiental de las aplicaciones y servicios informáticos desarrollados por la Universidad(AU)

Applications and computer services implementation in the health sector is one of the information and communications technologies challenges. Medical informatics as an integrating discipline receives an important impact from the science, technology and society approach that dominates the biomedical field, biotechnological and pharmaceutical sciences. The Informatics Sciences University (UCI) since the beginnings has participated in the development of applications and computer services for the Cuban health sector. UCI has developed and implemented the Medical Imaging Platform, the Hospital Information System, and the Clinical Trials Data Management System. These applications introduced in the Cuban society a valuable social, economic and cultural-organizational benefit. Additionally those applications contributed to the health institutions management and the economic efficiency. This paper describes the social, economic and environmental impact of the applications and computer services developed by the university(AU)

Software de gestión y análisis de los casos de intoxicaciones por plaguicidas - PlaguiTox / Management and analysis software for pesticide poisoning cases - PlaguiTox

Introducción: El Centro Nacional de Toxicología de Cuba, supervisa y controla la información de eventos atribuibles a la inmunización, vacunación e intoxicaciones con medicamentos y plaguicidas. Los casos que llegan al centro, se justifican mayormente por el uso de plaguicidas que tienen un alto nivel de toxicidad y riesgo de muerte. Los especialistas en toxicología, requieren facilidad para revisar las hojas de seguridad, el listado oficial de plaguicidas autorizados en Cuba y los casos anteriores. Esto permite analizar y emitir un diagnóstico, que salve la vida del afectado. Objetivo: Presentar un sistema para la gestión y el análisis de los casos intoxicados por plaguicidas. Métodos: El desarrollo se sustentó en la metodología de software Extreme Programming, modelado con la herramienta CASE Visual Paradigm 8.0 y lenguaje UML 2.0. Se utilizó Java con NetBeans 8.0.2 y como gestor de base de datos PostgreSQL 9.3. Resultados: Se desarrolló una herramienta de gestión de la información toxicológica, así como una base de casos de los síntomas, plaguicidas y diagnóstico por plaguicida. Los especialistas en toxicología cuentan con una herramienta de apoyo a la toma de decisiones, que reduce la ocurrencia de errores humanos(AU)

Introduction: The Cuban National Toxicology Center supervises and controls the information of events attributable to immunization, vaccination and poisonings with medications and pesticides. The cases that arrive at the center are mainly justified by the use of pesticides that have a high level of toxicity and risk of death. Specialists in toxicology require ease to review the safety sheets, the official list of authorized pesticides in Cuba and the above cases. This allows analyzing and issuing a diagnosis that saves the life of the affected person. Objective: To present a system for the management and analysis of cases poisoned by pesticides. Methods: The development was based on the Extreme Programming software methodology, modeled with the CASE Visual Paradigm 8.0 tool and the UML 2.0 language. Java was used with NetBeans 8.0.2 and as PostgreSQL 9.3 database manager. Results: A toxicological information management tool was developed, as well as a case database of symptoms, pesticides and pesticide diagnosis. Toxicology specialists have a decision support tool that reduces the occurrence of human errors(AU)

Diagnóstico de la variabilidad de los procesos hospitalarios en Cuba / Diagnosis of hospitals processes' variability in Cuba

Introducción: Los procesos sanitarios se producen, generalmente, en entornos cambiantes y lo conducen profesionales con formación y criterios diversos, cuyas decisiones son las que condicionan las prácticas. La variabilidad impacta negativamente sobre funciones gerenciales importantes como la planificación, la gestión, el control de los recursos y la calidad de los servicios. Objetivo: Diagnosticar el estado actual de la variabilidad en la ejecución de los procesos hospitalarios en Cuba. Métodos: El estudio se realizó en los meses de enero a mayo de 2016 y participaron instituciones de subordinación nacional. Se encuestaron a 49 especialistas en gestión hospitalaria y 29 analistas de procesos de negocio. Para el diagnóstico se utilizó como herramienta metodológica la investigación acción, se aplicarón las técnicas: entrevistas, encuestas, el análisis de campos de fuerzas, el grupo focal, la herramienta del diagrama causa-efecto y el método de estudio de casos. El análisis documental se empleó para identificar las principales causas que limitan la detección de variabilidad en la ejecución de procesos hospitalarios. Resultados: Los resultados más relevantes permiten asegurar que no es posible realizar la planificación, control y gestión de los recursos de forma eficiente, si no se detecta y reduce la variabilidad. Los métodos que se están empleando actualmente en Cuba, no son suficientes para analizar y comprender el comportamiento de la variabilidad hospitalaria. Conclusiones: Las técnicas de modelado y los métodos existentes para reducir la variabilidad no son efectivos en el entorno sanitario cubano, por la alta variabilidad en sus procesos y la complejidad que poseen estas técnicas hospitalarias para apoyar a la toma de decisiones, elementos a tener en cuenta para su aplicación en Cuba(AU)

Introduction: Health processes are frequently subject to changing environments and are governed by professionals with different backgrounds and criteria, whose decisions influence the practices. Variability negatively impacts on important managerial functions such as planning, management, control of resources and the quality of services. Objective: To perform a diagnosis on the current state of the variability in the implementation of hospital's processes in Cuba. Methods: A research was carried out from January to May, 2016 and institutions of national subordination also participated. There were interviewed 49 specialists with experience in hospital management and 29 business process analysts. As methodological tool for diagnosis, it was used research-action, and there were applied techniques as: interviews, surveys, analysis of force fields, focal group, the tool of cause-effect's diagram, and the method of cases study. Documentary analysis was used to identify the main causes that limit the detection of variability in the implementation of hospitals processes. Results: The most relevant results allow ensuring that it is not possible to effectively contribute to the planning, control and management of resources without detecting and reducing variability. The methods currently used in Cuba are not enough to analyze and understand the behavior of hospital variability. Conclusions: The modeling techniques and the existing methods to reduce variability are not effective in the Cuban health environments, due to the high variability in the processes and the complexity that these techniques present. In Cuba there is a need to detect the variability in hospital processes to support the decision making in this regard(AU)

Analysis of Hospital Processes with Process Mining Techniques.

Process mining allows for discovery, monitoring, and improving processes identified in information systems from their event logs. In hospital environments, process analysis has been a crucial factor for cost reduction, control and proper use of resources, better patient care, and achieving service excellence. This paper presents a new component for event logs generation in the Hospital Information System or HIS, developed at University of Informatics Sciences. The event logs obtained are used for analysis of hospital processes with process mining techniques. The proposed solution intends to achieve the generation of event logs in the system with high quality. The performed analyses allowed for redefining functions in the system and proposed proper flow of information. The study exposed the need to incorporate process mining techniques in hospital systems to analyze the processes execution. Moreover, we illustrate its application for making clinical and administrative decisions for the management of hospital activities.

Componente web para el análisis de información clínica usando la técnica de Minería de Datos por agrupamiento / Web component for the analysis of clinical information using the technique of clustering data mining

La digitalización de los diferentes procesos y la automatización de los servicios generan grandes volúmenes de información. La Minería de Datos (MD) es una técnica de Inteligencia Artificial que permite encontrar la información no trivial que reside en los datos almacenados. La presente investigación pretende desarrollar una vista de análisis para el Sistema Integral para la Atención Primaria de Salud (SIAPS), usando la técnica de agrupamiento enmarcada en el algoritmo Simple K-Means, con el objetivo de realizar un análisis de la información clínica de los pacientes; para ello se plantea la extracción del conocimiento del almacén de datos alimentado del repositorio de historias clínicas electrónicas. La investigación se sustenta en la herramienta de libre distribución WEKA, esta funciona de forma aislada al SIAPS; la interfaz, así como las vistas, modelos e informes generados por WEKA en ocasiones resultan de difícil comprensión por los profesionales de la salud, los que no necesariamente tienen que poseer conocimientos avanzados de las nuevas tecnologías de la información. Para el desarrollo de la solución se empleó el lenguaje de programación Java 1,6, como servidor de aplicación JBoss 4,2 y Eclipse 3,4 como plataforma de desarrollo, como Sistema Gestor de Bases de Datos PostgreSQL 8,4 y SEAM como framework de integración. Durante todo el proceso se hizo uso de la plataforma Java Enterprise Edition 5, 0. Como resultado se espera obtener una vista de análisis que facilite la comprensión de los modelos generados, apoyando de esta forma el proceso de toma de decisiones clínicas(AU)

The digitization of the different processes and automation services generate large volumes of information. Data mining (DM) is an artificial intelligence technique that allows finding non-trivial information residing in stored data. This research aims to develop a view of analysis for the Integral System for Primary Health Care (SIAPS), using grouping technique framed on Simple K-Meansalgorithm, with the goal of completing an analysis of the patients' clinical information, for it raises the extraction of knowledge from data warehouse powered by the repository of electronic medical records. The research is based on the free distribution tool WEKA, it works in isolation of SIAPS, the interface, as well as the views, models and reports generated by WEKA are sometimes difficult to understand by health professionals, who do not necessarily have to possess advanced knowledge of new information technologies. For the development of the solution was used Java 1.6 as a programming language, JBoss 4.2 as the application Server and Eclipse 3.4 as a development platform. PostgreSQL 8.4 was used as Database Management System and the integration framework SEAM. Java Enterprise Edition 5.0 platform was used during the whole process. An analysis view to facilitate the understanding of the generated models is expected as a result, to support the process of making clinical decisions(AU)

Componente web para el análisis de información clínica usando la técnica de Minería de Datos por agrupamiento / Web component for the analysis of clinical information using the technique of clustering data mining

La digitalización de los diferentes procesos y la automatización de los servicios generan grandes volúmenes de información. La Minería de Datos (MD) es una técnica de Inteligencia Artificial que permite encontrar la información no trivial que reside en los datos almacenados. La presente investigación pretende desarrollar una vista de análisis para el Sistema Integral para la Atención Primaria de Salud (SIAPS), usando la técnica de agrupamiento enmarcada en el algoritmo Simple K-Means, con el objetivo de realizar un análisis de la información clínica de los pacientes; para ello se plantea la extracción del conocimiento del almacén de datos alimentado del repositorio de historias clínicas electrónicas. La investigación se sustenta en la herramienta de libre distribución WEKA, esta funciona de forma aislada al SIAPS; la interfaz, así como las vistas, modelos e informes generados por WEKA en ocasiones resultan de difícil comprensión por los profesionales de la salud, los que no necesariamente tienen que poseer conocimientos avanzados de las nuevas tecnologías de la información. Para el desarrollo de la solución se empleó el lenguaje de programación Java 1.6, como servidor de aplicación JBoss 4.2 y Eclipse 3.4 como plataforma de desarrollo, como Sistema Gestor de Bases de Datos PostgreSQL 8.4 y SEAM como framework de integración. Durante todo el proceso se hizo uso de la plataforma Java Enterprise Edition 5.0. Como resultado se espera obtener una vista de análisis que facilite la comprensión de los modelos generados, apoyando de esta forma el proceso de toma de decisiones clínicas(AU)

The digitization of the different processes and automation services generate large volumes of information. Data mining (DM) is an artificial intelligence technique that allows finding non-trivial information residing in stored data. This research aims to develop a view of analysis for the Integral System for Primary Health Care (SIAPS), using grouping technique framed on Simple K-Means algorithm, with the goal of completing an analysis of the patients' clinical information, for it raises the extraction of knowledge from data warehouse powered by the repository of electronic medical records. The research is based on the free distribution tool WEKA, it works in isolation of SIAPS, the interface, as well as the views, models and reports generated by WEKA are sometimes difficult to understand by health professionals, who do not necessarily have to possess advanced knowledge of new information technologies. For the development of the solution was used Java 1.6 as a programming language, JBoss 4.2 as the application Server and Eclipse 3.4 as a development platform. PostgreSQL 8.4 was used as Database Management System and the integration framework SEAM. Java Enterprise Edition 5.0 platform was used during the whole process. An analysis view to facilitate the understanding of the generated models is expected as a result, to support the process of making clinical decisions(AU)